灵山县水利局现有16个职能股、站(室)，其中，机关内设三个股室：行政股、财务股、水政水资源股;下属事业单位10个：水利工程管理站、灵山县水利设计室、灵山县水土保持站(挂县水土保持监督执法站牌子)、灵山县水利局综合服务站、灵山县水政监察大队、灵山县机电技术站、灵山县水利机械施工队、灵山县思明水库管理处、灵山县长安水库工程管理所、灵山县新胜塘水库管理处。局直属二层企业事业单位3个：水泥制品厂、机电设备厂、桂南电线厂。

灵山县水利局现有干部职工70人，党员43人，在县委县政府的领导下，牢固树立科学发展观，大力弘扬“献身、负责、求实”的水利行业精神，解放思想，求真务实，全力推进全县水利事业的可持续发展。建国五十多年来，全县共建成各类水利水电工程4566宗，其中大中型水库154座，为社会主义新农村建设提供了强力支撑。近年来，先后被国家水利部、财政部评为“水土保持生态环境建设示范县”、“农田水利建设先进县”，被自治区列为全区“小农水改革”和“民办公助”示范县，防汛工作、农田水利建设、水保水政工作连年受到区、市、县的嘉奖，农田水利建设和水利管理体制改革经验被《中国水利报》设专版作亮点报道。灵山水务工作以强劲的发展态势为建设富裕灵山、生态灵山、文化灵山、和谐灵山作出了贡献。